网站必做外链贵阳app下载

张小明 2026/1/2 12:41:22
网站必做外链,贵阳app下载,私人建网站需要什么,怎样在百度上发布免费广告真核基因组并非杂乱无章地分布在细胞核内#xff0c;而是以高度有序的染色质结构存在。通过染色质构象捕获技术及其衍生的Hi-C、ChIA-PET等多种高通量手段#xff0c;人们发现基因组在三维空间中形成了诸如A、B compartments#xff0c;拓扑相关结构域#xff08;TADs…真核基因组并非杂乱无章地分布在细胞核内而是以高度有序的染色质结构存在。通过染色质构象捕获技术及其衍生的Hi-C、ChIA-PET等多种高通量手段人们发现基因组在三维空间中形成了诸如A、B compartments拓扑相关结构域TADs和染色质环等精细结构。这些结构直接参与了增强子与启动子之间的相互作用与基因的激活和沉默密切相关在转录调控过程中发挥着举足轻重的作用。然而传统3D基因组数据库多聚焦单物种分析难以实现跨物种的比较研究。河北农业大学研究人员发表于《Plant Communications》标题为《An integrative 3D-genome database for plants》的数据库资源文章成功构建了3D-GDP数据库。该数据库打破单物种研究局限整合了银杏、水稻、棉花等26种植物的3D基因组数据提供从可视化到功能分析的“一站式”平台为解析植物3D基因组进化与基因调控机制开辟新路径。数据库链接http://www.3d-gdp.com/数据库首页数据库数据规模基因组覆盖涵盖26种植物的383条染色体注释1,528,029个基因覆盖从裸子植物到双子叶植物的主要进化分支。3D结构数据包含约111,904个TADs拓扑关联结构域、8,678,833个染色质环所有数据均来自公开的植物Hi-C数据。注释信息整合转录因子TF定位、蛋白互作网络、增强子预测拟南芥专属等信息其中蛋白互作数据来自STRING数据库功能注释基于GO和KEGG完成标准化处理。数据库六大核心模块3D Structure 模块通过模拟染色质互作信息直观展示每种植物染色质在细胞核内的空间分布支持叠加注释如A/B compartments、TAD位置、基因/TF/增强子定位用户可选择物种、染色体自定义添加注释图层通过交互式界面缩放浏览还可下载标注表格。Compartment 模块预测26种植物的A/B compartmentsA区为活跃染色质B区为异染色质支持跨物种共线性与compartment结构的联合比较通过热图和点图直观展示不同植物间的结构保守性。TAD 模块不仅可视化单物种TAD分布还能通过“两物种比对”“多物种比对”模式识别保守TAD并预测其功能——包括分析TAD内基因的蛋白互作网络、计算互作率以及基于GO/KEGG的功能富集。Loop 模块通过Circos图展示跨物种保守染色质环支持用户查询环两端5kb内的同源基因识别“结构保守-基因功能关联”的调控单元。Blast 模块用户可上传核酸/蛋白序列选择目标物种后数据库自动匹配高相似度序列所在的TAD快速关联“基因序列-TAD结构”助力解析目标基因的3D调控背景。JBrowse 模块基于JBrowse2开发支持实时缩放、平移可同时展示基因组序列、基因注释、Hi-C接触热图、TAD/loop结构兼容BEDPE、BED、HIC等格式的本地数据上传方便研究者对比自有数据与数据库参考数据。3D-GDP的构建3D-GDP作为首个面向植物的多物种三维基因组比较平台成功整合了26个物种的Hi-C数据与多组学注释提供了从结构可视化、保守性分析到功能预测的一站式工具链显著拓展了植物染色质结构研究的深度与广度。无论是解析植物3D基因组的进化规律还是挖掘基因调控的结构基础3D-GDP都将成为植物科研领域的核心工具。即刻访问数据库开启你的 “三维基因组探索之旅” 吧参考文献Yang Q, Wu T, Liu M, et al. An integrative 3D-genome database for plants[J]. Plant Communications, 2025, 6: 101346.VGsoft Team凌恩开发团队于2015年成立致力于为多组学相关生命科学研究提供数据库和信息化解决方案。开发团队骨干由十年以上项目经验的资深软件工程师和生 信工程师构成可提供灵活多样的数据库构建及信息化服务。服务项目包括物种数据库、多组学数据库、eDNA数据库、育种平台、生信云平台等客户涵盖高校、科研院所、三甲医院及上市公司等项目成果发表在Cell, Nucleic Acids Research, Molecular Therapy, Horticulture Research等国际著名期刊上。每一个研究领域都至少需要一个数据库凌恩 生物开发团队秉持“数据驱动创新客户赋能未来”的理念提升科研价值巩固数据成果锁定领域影响。更多凌恩项目案例见http://vgsoft.biozeron.com/bmstor/database/anima
版权声明:本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系邮箱:809451989@qq.com进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

旅游网站的建设的意义网站简易后台

文章目录系统截图项目技术简介可行性分析主要运用技术介绍核心代码参考示例结论源码lw获取/同行可拿货,招校园代理 :文章底部获取博主联系方式!系统截图 python-uniapp_mssyk 小程序敏感内容智能识别的某某派出所举报系统 项目技术简介 Python版本…

张小明 2025/12/29 14:22:30 网站建设

奕腾网站建设wordpress 环境要求

还在为手机里装满了各种直播APP而苦恼吗?每次想看不同平台的直播都要来回切换,操作繁琐不说,还容易错过精彩内容。Dart Simple Live作为一款基于Flutter技术打造的开源直播聚合应用,完美解决了这一痛点,让你在一个应用…

张小明 2025/12/29 12:49:42 网站建设

网站制作心得体会200字百度搜寻网站缩略图如何添加

目录已开发项目效果实现截图关于我系统介绍开发技术路线核心代码参考示例本项目开发思路结论源码lw获取/同行可拿货,招校园代理 :文章底部获取博主联系方式!已开发项目效果实现截图 同行可拿货,招校园代理 Python_byn79卖_ 植物绿植盆景销售商城…

张小明 2025/12/31 11:27:05 网站建设

淄博网站建设哪家便宜网站建设人才有哪些

基于三有源桥的模型预测控制仿真,可以独立控制输出侧两个端口的电压或者电流,动态响应快,也可以扩展至四有源桥电路。最近在研究基于三有源桥的模型预测控制(MPC)仿真,发现这东西挺有意思的。三有源桥电路结…

张小明 2025/12/30 0:45:41 网站建设

建设网站运营网页设计尺寸高度

微软 Outlook 与 Outlook Express 使用及故障排除指南 在日常使用微软 Outlook 和 Outlook Express 进行邮件管理时,我们可能会遇到各种问题,同时也需要掌握一些有效的维护和管理技巧。下面将详细介绍相关内容。 新闻组的使用与退订 新闻组是帮助终端用户自主解决问题的有…

张小明 2025/12/29 20:11:29 网站建设

郑州市住房和城乡建设厅网站网站建设公司怎么选择

掌握Avalonia:7个必学示例助你成为跨平台UI开发高手 【免费下载链接】Avalonia AvaloniaUI/Avalonia: 是一个用于 .NET 平台的跨平台 UI 框架,支持 Windows、macOS 和 Linux。适合对 .NET 开发、跨平台开发以及想要使用现代的 UI 框架的开发者。 项目地…

张小明 2025/12/30 8:17:40 网站建设